MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Caldicellulosiruptor saccharolyticus DSM 8903 chromosome

Total Repeats: 68832

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009437	TTGA	2	8	82	89	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009437	ATT	2	6	148	153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009437	CAAAAT	2	12	174	185	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_009437	AAATTA	2	12	190	201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009437	TTAAA	2	10	211	220	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009437	CAAATT	2	12	230	241	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_009437	AAT	2	6	344	349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009437	AAT	2	6	394	399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009437	TTG	2	6	440	445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009437	AAT	2	6	451	456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009437	T	8	8	456	463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009437	AT	3	6	465	470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009437	T	7	7	575	581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009437	TTAC	2	8	607	614	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_009437	TACA	2	8	617	624	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_009437	GGA	2	6	671	676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146295086
17	NC_009437	AGG	2	6	682	687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146295086
18	NC_009437	A	6	6	693	698	100 %	0 %	0 %	0 %	146295086
19	NC_009437	ACA	2	6	730	735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146295086
20	NC_009437	TGA	2	6	767	772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146295086
21	NC_009437	AAG	2	6	946	951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146295086
22	NC_009437	CAA	2	6	967	972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146295086
23	NC_009437	ACA	2	6	1015	1020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146295086
24	NC_009437	TGC	3	9	1034	1042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146295086
25	NC_009437	ACC	2	6	1061	1066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146295086
26	NC_009437	ATGC	2	8	1131	1138	25 %	25 %	25 %	25 %	146295086
27	NC_009437	CCA	2	6	1145	1150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146295086
28	NC_009437	ATGT	2	8	1182	1189	25 %	50 %	25 %	0 %	146295086
29	NC_009437	GCA	2	6	1221	1226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146295086
30	NC_009437	TGA	2	6	1244	1249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146295086
31	NC_009437	TTGA	2	8	1284	1291	25 %	50 %	25 %	0 %	146295086
32	NC_009437	AAAG	2	8	1314	1321	75 %	0 %	25 %	0 %	146295086
33	NC_009437	AAG	2	6	1327	1332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146295086
34	NC_009437	CA	3	6	1341	1346	50 %	0 %	0 %	50 %	146295086
35	NC_009437	AC	3	6	1351	1356	50 %	0 %	0 %	50 %	146295086
36	NC_009437	GCC	2	6	1397	1402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146295086
37	NC_009437	AGA	2	6	1421	1426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146295086
38	NC_009437	AG	3	6	1587	1592	50 %	0 %	50 %	0 %	146295086
39	NC_009437	A	6	6	1707	1712	100 %	0 %	0 %	0 %	146295086
40	NC_009437	AGA	2	6	1769	1774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146295086
41	NC_009437	ATC	2	6	1781	1786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146295086
42	NC_009437	AAG	2	6	1787	1792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146295086
43	NC_009437	AG	3	6	1839	1844	50 %	0 %	50 %	0 %	146295086
44	NC_009437	CA	3	6	1896	1901	50 %	0 %	0 %	50 %	146295086
45	NC_009437	A	6	6	1921	1926	100 %	0 %	0 %	0 %	146295086
46	NC_009437	CAA	2	6	1940	1945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146295086
47	NC_009437	A	7	7	1979	1985	100 %	0 %	0 %	0 %	146295086
48	NC_009437	AAC	2	6	2006	2011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146295086
49	NC_009437	TG	3	6	2025	2030	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009437	CA	3	6	2124	2129	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_009437	TAT	2	6	2149	2154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009437	TAC	3	9	2158	2166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_009437	TTTA	2	8	2176	2183	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009437	AGG	2	6	2213	2218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009437	TGT	2	6	2235	2240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146295087
56	NC_009437	ATA	2	6	2261	2266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146295087
57	NC_009437	CTG	2	6	2282	2287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146295087
58	NC_009437	CAA	2	6	2294	2299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146295087
59	NC_009437	AGA	2	6	2337	2342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146295087
60	NC_009437	ATGCAA	2	12	2374	2385	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	146295087
61	NC_009437	AGC	2	6	2418	2423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146295087
62	NC_009437	A	6	6	2457	2462	100 %	0 %	0 %	0 %	146295087
63	NC_009437	CTTC	2	8	2464	2471	0 %	50 %	0 %	50 %	146295087
64	NC_009437	ATA	2	6	2485	2490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146295087
65	NC_009437	AG	3	6	2491	2496	50 %	0 %	50 %	0 %	146295087
66	NC_009437	AGA	2	6	2522	2527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146295087
67	NC_009437	GCA	2	6	2608	2613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146295087
68	NC_009437	GAT	2	6	2818	2823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146295087
69	NC_009437	ATA	2	6	2833	2838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146295087
70	NC_009437	GAA	2	6	2845	2850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146295087
71	NC_009437	T	6	6	2941	2946	0 %	100 %	0 %	0 %	146295087
72	NC_009437	CAA	2	6	2978	2983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146295087
73	NC_009437	CAG	2	6	2996	3001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146295087
74	NC_009437	AG	3	6	3009	3014	50 %	0 %	50 %	0 %	146295087
75	NC_009437	ATG	2	6	3091	3096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146295087
76	NC_009437	GTCAT	2	10	3103	3112	20 %	40 %	20 %	20 %	146295087
77	NC_009437	GAA	2	6	3133	3138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146295087
78	NC_009437	GGA	2	6	3223	3228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146295087
79	NC_009437	TACAT	2	10	3238	3247	40 %	40 %	0 %	20 %	146295087
80	NC_009437	AGC	2	6	3272	3277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146295087
81	NC_009437	ATCT	2	8	3295	3302	25 %	50 %	0 %	25 %	146295087
82	NC_009437	T	6	6	3333	3338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009437	GAT	2	6	3357	3362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146295088
84	NC_009437	T	6	6	3409	3414	0 %	100 %	0 %	0 %	146295088
85	NC_009437	CTT	2	6	3472	3477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146295088
86	NC_009437	TA	3	6	3483	3488	50 %	50 %	0 %	0 %	146295088
87	NC_009437	TCA	2	6	3533	3538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146295088
88	NC_009437	TAT	2	6	3602	3607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146295088
89	NC_009437	AAT	2	6	3636	3641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146295088
90	NC_009437	GAA	2	6	3651	3656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146295088
91	NC_009437	AATA	2	8	3657	3664	75 %	25 %	0 %	0 %	146295088
92	NC_009437	CGA	2	6	3748	3753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146295088
93	NC_009437	TGA	2	6	3827	3832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146295088
94	NC_009437	T	6	6	3843	3848	0 %	100 %	0 %	0 %	146295088
95	NC_009437	ATA	2	6	3871	3876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146295088
96	NC_009437	A	8	8	3921	3928	100 %	0 %	0 %	0 %	146295088
97	NC_009437	CAA	2	6	3959	3964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146295088
98	NC_009437	CAT	2	6	4031	4036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146295088
99	NC_009437	CAGC	2	8	4056	4063	25 %	0 %	25 %	50 %	146295088
100	NC_009437	AAG	2	6	4066	4071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146295088
101	NC_009437	GAT	2	6	4123	4128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146295088
102	NC_009437	TGCA	2	8	4191	4198	25 %	25 %	25 %	25 %	146295088
103	NC_009437	TC	3	6	4205	4210	0 %	50 %	0 %	50 %	146295088
104	NC_009437	GAT	2	6	4252	4257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146295088
105	NC_009437	AT	3	6	4256	4261	50 %	50 %	0 %	0 %	146295088
106	NC_009437	A	6	6	4280	4285	100 %	0 %	0 %	0 %	146295088
107	NC_009437	A	6	6	4287	4292	100 %	0 %	0 %	0 %	146295088
108	NC_009437	ATAA	2	8	4384	4391	75 %	25 %	0 %	0 %	146295088
109	NC_009437	TCT	2	6	4409	4414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_009437	A	6	6	4418	4423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009437	TGT	2	6	4469	4474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146295089
112	NC_009437	CTT	2	6	4488	4493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146295089
113	NC_009437	TTG	2	6	4573	4578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146295089
114	NC_009437	GAT	2	6	4587	4592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146295089
115	NC_009437	TC	3	6	4645	4650	0 %	50 %	0 %	50 %	146295089
116	NC_009437	CAA	3	9	4660	4668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146295089
117	NC_009437	ACT	2	6	4708	4713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146295089
118	NC_009437	ATTTT	2	10	4733	4742	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009437	ACA	2	6	4784	4789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	346722695
120	NC_009437	A	6	6	4789	4794	100 %	0 %	0 %	0 %	346722695
121	NC_009437	TA	3	6	4871	4876	50 %	50 %	0 %	0 %	346722695
122	NC_009437	TCA	2	6	4900	4905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	346722695
123	NC_009437	TTG	2	6	4920	4925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	346722695
124	NC_009437	A	6	6	5052	5057	100 %	0 %	0 %	0 %	346722695
125	NC_009437	GTA	2	6	5069	5074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	346722695
126	NC_009437	GT	3	6	5112	5117	0 %	50 %	50 %	0 %	346722695
127	NC_009437	TGT	2	6	5155	5160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	346722695
128	NC_009437	TGC	2	6	5349	5354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722695
129	NC_009437	GGATAA	2	12	5388	5399	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	346722695
130	NC_009437	TGA	2	6	5407	5412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	346722695
131	NC_009437	GA	4	8	5411	5418	50 %	0 %	50 %	0 %	346722695
132	NC_009437	A	7	7	5418	5424	100 %	0 %	0 %	0 %	346722695
133	NC_009437	ACA	2	6	5607	5612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	346722695
134	NC_009437	CAA	2	6	5616	5621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	346722695
135	NC_009437	AC	3	6	5633	5638	50 %	0 %	0 %	50 %	346722695
136	NC_009437	GCT	2	6	5654	5659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	346722695
137	NC_009437	A	7	7	5686	5692	100 %	0 %	0 %	0 %	346722695
138	NC_009437	GCA	2	6	5864	5869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	346722695
139	NC_009437	AGA	2	6	5875	5880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	346722695
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